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R.E.D. Laboratories propose
le test Phelix Phage : une nouvelle méthode révolutionnaire pour détecter les bactéries intracellulaires et répondre aux personnes malades non diagnostiquées
Qu'est-ce que les bactériophages?
Les phages appartiennent à la forme la plus simple et la plus primitive de vie (les virus). Ils sont extrêmement spécifiques de l'hôte bactérien qu'ils infectent pour se propager. Ils peuvent rapidement infecter leur hôte et insérer leur matériel génétique dans celui-ci. Par conséquent, ils produisent de grandes quantités de copies qui peuvent infecter davantage (et dans certains cas spécifiques décimer) les bactéries causant l'infection. Ils peuvent également rendre les bactéries vulnérables au traitement classique en altérant leur matériel génétique.
Plus important encore, les bactériophages peuvent avoir une capacité de destruction. Les phages sont si petits qu'ils peuvent pénétrer et finalement perturber les biofilms bactériens. Ces biofilms sont une barrière majeure utilisée par les bactéries contre les antibiotiques et donc un contributeur important à la résistance aux antibiotiques. La capacité des phages à pénétrer les biofilms leur permet de se propager à des niveaux élevés dans les centres localisés de l'infection bactérienne et de détruire les bactéries à l'intérieur d'eux, pour produire un effet thérapeutique fort, mais très localisé.
Les bactériophages sont omniprésents et font partie du 'écosystème' naturel des bactéries vivant et se répliquant. Nous avons décidé de nous concentrer sur les bactériophages en tant que cible pour la détection directe d'une infection, car ils sont spécifiques et surpassent la population bactérienne pathogène.
Inventeurs:
Docteur Jinyu Shan (University of Leicester)
Professeur Martha Clokie (University of Leicester)
Docteur Louis Teulières (Phelix)
Phelix Phage Test est également disponible pour détecter un large éventail de rickettsies : Rickettsia japonica (plusieurs souches) ; Rickettsia heilongjiangensis (souches multiples) ; Rickettsia parkeri (plusieurs souches) ; Rickettsia raoultii (plusieurs souches) ; Rickettsia rickettsia (plusieurs souches); Rickettsia slovaca (souches multiples) ; Rickettsia montanensis; Paon Rickettsia; Rickettsia africaine; Rickettsia conorii.
Test Phelix Phage Borrelia - Publications scientifiques
Cibler les gènes prophages multicopie pour une détection accrue de Borrelia burgdorferi Sensu Lato (s.l.), the Causative Agents of Lyme Disease, in Blood.
Shan J, Jia Y, Teulières L, Patel F, Clokie MRJ.
Front Microbiol. 2021 Mar 15;12:651217. doi: 10.3389/fmicb.2021.651217. PMID: 33790883; PMCID: PMC8005754.
Combinaison de la science citoyenne et des méthodes de diagnostic moléculaire pour étudier la prévalence de Borrelia burgdorferi s.l. and Borrelia miyamotoi in tick pools across Great Britain.
Shan J, Jia Y, Hickenbotham P, Teulières L, Clokie MRJ.
Front Microbiol. 2023 Apr 26;14:1126498. doi: 10.3389/fmicb.2023.1126498. PMID: 37180256; PMCID: PMC10169747.
Overcoming the Challenges of Lyme Disease Diagnosis: The Role of Phage-based Testing.Jia Y, Mijatovic T, Teulières L, Clokie M, Shan J. Medical Research Archives, [S.l.], v. 11, n. 11, nov. 2023. ISSN 2375-1924. Available at: <https://esmed.org/MRA/mra/article/view/4650>. Date accessed: 16 jan. 2024. doi: https://doi.org/10.18103/mra.v11i11.4650.
Animation du cycle de vie des phages du Dr Teulières 2020
Pour en savoir plus sur les bactériophages en général, veuillez regarder cette vidéo: L’incroyable histoire des tueurs de bactéries ARTE 22
Dr Louis Teulières Phelix Phage Borrelia Test update
Mise à jour du test Phelix Phage Borrelia du Dr Louis Teulières en français
Dr Louis Teulières presents bacteriophages (Phage) Borrelia test
Le Dr Louis Teulières présente les bactériophages test borrelia
Pourquoi utiliser les bactériophages comme outil de diagnostic?
Les infections transmises par les tiques augmentent dans le monde entier - la maladie de Lyme est parmi les infections vectorielles les plus répandues aux États-Unis et en Europe et atteint des niveaux épidémiques (Kugeler et al. 2015; Sykes et al. 2014). Alors que la plupart des tiques ont la capacité de transmettre plusieurs agents pathogènes causant des maladies humaines, la maladie de Lyme est la maladie transmise par les tiques la plus connue et est causée par des bactéries du genre Borrelia; typiquement Borrelia burgdorferi qui sont des bactéries spirochètes gram-négatif.
Borrelia est divisé en "génospecies"; parmi les plus courants se trouvent B. burgdorferi sensu stricto, B. garinii, B. afzelii, B. spielmanii, B. bavariensis et le nouveau B. miyamotoi. Le taux élevé d'échec global des tests liés aux infections transmises par les tiques (TBI) souligne la nécessité d'approches novatrices, c'est-à-dire ne pas se fier à la sérologie et aux tests à deux étapes.
Les tests basés sur la PCR sont de plus en plus utilisés en milieu clinique et présentent plusieurs avantages distincts par rapport à la sérologie. Ils détectent directement la présence d'agents infectieux. Contrairement à la sérologie, ils ne reposent pas sur le développement d'anticorps, qui peut prendre plusieurs semaines, et tous les patients ne sont pas en mesure de les développer. Cependant, les tests PCR ont également des limites : les tests ADN ne font pas la distinction entre les organismes vivants et morts.
Le concept est que nous ne cherchons plus la bactérie mais son bactériophage obligatoire, qui cherche à trouver la bactérie pour survivre. Le matériel génétique du bactériophage est spécifique à la bactérie avec laquelle il est associé. Cela signifie que les différentes espèces de bactéries auront différents bactériophages.
Les bactériophages sont présents uniquement lors d'infections bactériennes actives ; ainsi, un test basé sur les phages est une preuve directe d'une infection active. Le principal problème actuel des PCR détectant Borrelia est leur faible sensibilité. Nous avons développé une méthode directe et spécifique qui est plus sensible. Notre méthode de détection (brevetée par Phelix R&D et l'Université de Leicester, WO2018083491A1) consiste à cibler la présence de prophages prédominants faisant partie du cycle lysogénique des bactéries.
Plus précisément, une façon d'augmenter la sensibilité d'un test PCR est d'augmenter le nombre de cibles PCR. Contrairement aux méthodes PCR actuelles dans le diagnostic de la maladie de Lyme amplifiant des régions d'ADN génomique bactérien qui n'ont qu'une seule copie dans chaque bactérie (comme les gènes de l'ARNr 16S bactériens, le gène RecA et la région intergénique 5S-23S), nous proposons un test PCR basé sur les phages plus sensible pour détecter la maladie de Lyme et la fièvre récurrente causées par Borrelia burgdorferi sensu lato. Pour cela, nous ciblons une séquence d'ADN de phage spécifique à toutes les espèces de Borrelia : la maladie de Lyme et la fièvre récurrente
Nos projets actuels basés sur les phages se concentrent maintenant sur une série d'autres bactéries connues pour être impliquées dans des infections bactériennes chroniques telles que Rickettsia, Bartonella, Sutterella et Mycoplasma. Les bactériophages pourraient devenir un outil de diagnostic basé sur le principe que s'il y a des phages, c'est parce qu'il y a des bactéries vivantes. Les phages se trouvent dans le sang à la recherche désespérée de bactéries, car s'ils ne les trouvent pas, ils mourront. Et ils sont beaucoup plus nombreux que les bactéries (il y a 10 à 100 bactériophages par bactérie).
Cette approche offre une sensibilité accrue grâce au fait qu'il y a beaucoup plus de phages circulants que de bactéries, ce qui la rend précise et plus sensible que les tests PCR classiques qui sont souvent négatifs en raison de la faible concentration bactérienne dans le sang. C'est également un test DIRECT, mettant en évidence le propre matériel génétique de la bactérie dans le corps, contrairement à tous les tests indirects existants (ELISA, Western BLOT, test LTT/ELISPOT). Deuxièmement, cela permet de différencier les différents sous-types de bactéries (B. burgdorferi s.l., B. miyamotoi, …), ainsi que les fièvres récurrentes. Enfin, ce test est également le meilleur choix pour la détection précoce (rappelez-vous que les anticorps ont besoin de plusieurs semaines pour apparaître….).
Qu'est-ce que le test Phelix Phage ?
Le test Phelix Phage (brevet n° WO2018083491A1) est réalisé sur du sang total, mais peut également être utilisé pour tout autre matériau suspecté de contenir un pathogène donné (comme une biopsie, un liquide de ponction d'une articulation gonflée, du liquide cérébrospinal ou des tiques). La première étape consiste à extraire l'ADN à l'aide d'une méthode manuelle spécifique pour assurer la meilleure récupération possible de l'ADN du pathogène. L'ADN extrait subit une qPCR en utilisant des amorces brevetées et des sondes pour la détection spécifique d'un phage. Les fragments amplifiés sont ensuite analysés par séquençage afin de confirmer la positivité de l'échantillon (c'est-à-dire d'éliminer les faux positifs).
Cette technique est maintenant appliquée pour la toute première fois pour la détection de Borrelia (B. burgdorferi s.l. et éventuellement B. miyamotoi, B. hermsii, B. duttoniiBartonella, Rickettsia, etc). This technique is now tested for other tick- borne diseases (Bartonella, Rickettsia, etc). In order to further improve the assay, we are now testing the same procedure on urine samples. In line with this, all patients are receiving, in the testing kit, 2 EDTA tubes for the whole blood along with one container for the first morning urine. We aim to compare the test sensitivity between blood and urine and if this trial is conclusive it will enable a testing on urine and will thus bypass invasive blood draw, enabling easier testing for all patients and especially children. The test price comprises and supports this ongoing research and development.
Signification
Il est important d'analyser le résultat du test dans le contexte clinique de la personne testée. Le résultat du test PCR Phage est rapporté comme positif ou négatif. Dans certaines situations, il peut également être rapporté comme 'limite'; cela signifie que seuls de petits fragments d'ADN ont été trouvés (en raison de l'apoptose accrue, de la résolution de l'infection, etc). Un résultat positif signifie qu'au moment du test, le patient avait Borrelia présente dans son corps. Un résultat positif en l'absence de symptômes suggère que, malgré la présence de bactéries, le système immunitaire semble contrôler la situation. Dans le cas d'un test positif après un diagnostic sérologique récent ou précédent, il est important de discuter de la possibilité d'un stade tardif/syndrome post-lyme ou d'une forme chronique de borreliose.
Un résultat négatif signifie qu'au moment du test et dans un échantillon donné, la présence de Borrelia n'a pas été mise en évidence. Il est important de se rappeler que dans les stades tardifs, le nombre de bactéries est très faible et principalement caché dans les tissus ; par conséquent, le nombre de phages circulants sera également faible. Il est conseillé de refaire le test lorsque l'aggravation des symptômes est constatée. N'oubliez pas que les tiques transportent et transmettent de nombreux autres agents pathogènes (Bartonella, Rickettsia, Anaplasma, etc) qui donnent tous des symptômes très similaires.
Ainsi, un test négatif Borrelia avec des symptômes persistants pourrait suggérer la présence d'autres agents pathogènes. Enfin, il est également important de se rappeler que dans les stades tardifs, les symptômes reflètent des dysrégulations immunitaires et gastro-intestinales profondes résultant de maladies vectorielles non traitées précédemment. L'inflammation chronique et les infections de bas grade sont les complications résultantes des maladies vectorielles non découvertes et doivent donc être prises en compte en plus du dépistage de la présence d'un agent pathogène spécifique.
Phelix Phage Borrelia
